可視域での減衰は概ねフラットとなりますが、紫外域では高い減衰が生じます。また近赤外域では、ファイバに減衰を及ぼす水分により吸収帯域が750 nmおよび900 nm近辺に存在します。

各種グレーティングは、それぞれ異なるブレーズ波長やその他特性をもっているので各波長により反射効率が異なります。

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光学レンズはそれだけで波長特性をもっています。キュベットホルダやフィルタホルダなどサンプリングアクセサリにもコリメートレンズが用いられていますが、これらは焦点距離により異なる色収差をもつ単レンズとなります。

発光体でないサンプルの透過測定や反射測定に使用される各種光源も、種類により各波長に対する特性をもっています。各種光源の特性を考慮する必要がありますが、ブランクの透過光や標準白色拡散板からの反射光を基準光（リファレンス）とすることで生データスペクトルの規格化を行うことが可能です。

ディテクタの設計による特性と、電子回路の特性もまた分光器のシステム感度に影響を及ぼすことがあります。ディテクタの電圧シグナルは、暗電流シグナルによるオフセットおよび"ダーク"と呼ばれるアンプによる0（ゼロ）設定シグナルを含みます。またこれら素子間で少なからず感度差が生じますので、これらシグナルはディテクタの各素子で差し引かれる必要があります。

これら全ての要因を考慮し感度を規格化するためには、サンプルスペクトルをNIST準拠の標準光源を用いたリファレンススペクトルと比較、補正することが必要です。

% 透過率（i）または % 反射率（i）= [S（i）- D（i）] / [R（i）- D（i）] ×100

ここでのS（i）はピクセルi（ピクセル数)でのサンプル強度、D（i）はピクセルiでのダーク強度、およびR（i）はピクセルiでのリファレンス強度を示します。

吸光度（i）= -log[T（i）]

あるいは

エネルギー（i) = B（i）[T（i）]

ここでのB（i）はピクセルiでの標準光源のスペクトルを示します。